A USP está presente em 22 cidades no Estado de São Paulo, com campi em São Paulo, Bauru, Lorena, Ribeirão Preto, Piracicaba, Santos e São Carlos, e unidades de pesquisa em São Sebastião, no litoral do Estado, e em Montenegro, Rondônia.

Nestes locais, a presença da Universidade é referência, gerando impacto econômico e desenvolvimento, por meio do ensino, da pesquisa e do trabalho junto à sociedade. É para alcançar também as demais cidades do Estado de São Paulo que foi criado o programa USP Municípios, com o objetivo de melhorar e criar novas políticas públicas para os cidadãos dos municípios.

A missão do USP Municípios é construir parcerias com municípios paulistas para o incremento de políticas públicas que resultem em desenvolvimento sustentável, com base em valores como: ética, responsabilidade, inovação, justiça social, sustentabilidade e efetividade.